Viện Y Dược học Dân tộc thành phố Hồ Chí Minh là đơn vị đầu ngành khám bệnh, chữa bệnh bằng y, dược cổ truyền của 19 tỉnh, thành miền Nam (trong đó có thành phố Hồ Chí Minh) và 05 tỉnh Tây Nguyên, thực hiện các chức năng, nhiệm vụ do Bộ Y tế, Sở Y tế thành phố Hồ Chí Minh phân công; tổ chức khám và điều trị kết hợp Y học cổ truyền và Y học hiện đại trên các diện bệnh: Tiêu hóa – Gan mật, Nội thần kinh, Cơ xương khớp, Điều trị bệnh Trẻ em – Tự kỷ, Tai mũi họng, Nam giới, Hỗ trợ điều trị Ung bướu, Nội tim mạch, Ngoài da, Phụ khoa – Tư vấn hiếm muộn, Dinh dưỡng – Nội tiết, Hậu môn trực tràng…Với việc kết hợp các phương pháp dùng thuốc (Đông – Tây y kết hợp) và các phương pháp không dùng thuốc (Châm cứu, Xoa bóp day ấn huyệt, Bó thuốc, Vật lý trị liệu, Dưỡng sinh, Cấy chỉ, Thủy châm, Nhĩ châm…).